A nível nacional, AIDA CCI aposta no estabelecimento de parcerias institucionais com entidades da Administração Pública, Municípios, Instituições do Ensino Superior, Centros Tecnológicos, Associações Empresariais, entre outros, com destaque para os protocolos estabelecidos com as seguintes entidades:
- ADREDV - Agência de Desenvolvimento Regional de Entre Douro e Vouga
- APA - Administração do Porto de Aveiro
- APCER - Associação Portuguesa de Certificação
- APCER, SA (Protocolo especifico de cooperação com a AIDA CCI e ANEMM, para os mercados de Moçambique e S.Tomé)
- AVEIRO EXPO - Parque de Exposições, E.M.
- CEC/CCIC - Conselho Empresarial do Centro/Câmara de Comércio e Indústria do Centro
- CESAE - Centro de Serviços e Apoio às Empresas
- CIP - Confederação da Indústria Portuguesa
- EUROPARQUE - Centro Económico e Cultural
- IDAD - Instituto do Ambiente e Desenvolvimento
- NORGARANTE - Sociedade de Garantia Mútua
- Parque Ciência e Tecnologia da Universidade de Aveiro
- Pólo de Competitividade Engineering & Tooling ( POOL-NET)
- CLUSTER HABITAT SUSTENTÁVEL
- PÓLO DAS TICE
- PRODUTECH – PÓLO DAS RECNOLOGIAS DE PRODUÇÃO